Deux analyses d'expression génique

Le projet regroupe deux questions : ce qui change dans l'expression des gènes quand les cellules immunitaires ILC2 s'activent, et comment distinguer des sous-types de leucémie à partir de puces à ADN.

Ce que j'ai fait

Pour les ILC2, j'ai mené une analyse d'expression différentielle sur des données RNA-seq avec DESeq2, sous R et Bioconductor.

Pour les leucémies, j'ai réduit la dimension des données microarray par PCA, puis classé les échantillons par k plus proches voisins pour retrouver les sous-types moléculaires.